Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD40LGP29965 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms