Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD34P28906 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD34P28906 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms