Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YY1P25490 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YY1P25490 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
YY1P25490 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YY1P25490 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms