Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD53P19397 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD53P19397 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms