Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL7RP16871 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL7RP16871 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IL7RP16871 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IL7RP16871 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL7RP16871 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL7RP16871 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL7RP16871 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL7RP16871 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL7RP16871 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL7RP16871 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL7RP16871 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms