Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms