Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB3P14651 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms