Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF35P13682 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms