Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT10P13645 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT10P13645 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT10P13645 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT10P13645 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT10P13645 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT10P13645 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT10P13645 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT10P13645 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT10P13645 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT10P13645 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KRT10P13645 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KRT10P13645 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT10P13645 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms