Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD8P13378 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms