Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms