Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMP4P12644 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms