Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms