Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2P0DI81 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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