Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SFTPBP07988 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SFTPBP07988 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SFTPBP07988 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SFTPBP07988 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SFTPBP07988 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SFTPBP07988 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPBP07988 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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