Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP2O95045 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP2O95045 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP2O95045 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP2O95045 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP2O95045 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP2O95045 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP2O95045 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP2O95045 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP2O95045 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP2O95045 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP2O95045 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP2O95045 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP2O95045 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.7 ms