Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN7O94888 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms