Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMUO75648 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMUO75648 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms