Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms