Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN11O75508 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN11O75508 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms