Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms