Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms