Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPLO60437 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPLO60437 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPLO60437 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPLO60437 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPLO60437 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPLO60437 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms