Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DENRO43583 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DENRO43583 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DENRO43583 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms