Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms