Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms