Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTOA8MTQ0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms