Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms