Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms