Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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