Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms