Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms