Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNQ9UQP3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNQ9UQP3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNQ9UQP3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNQ9UQP3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNQ9UQP3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNQ9UQP3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNQ9UQP3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNQ9UQP3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNNQ9UQP3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNNQ9UQP3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNNQ9UQP3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNNQ9UQP3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNQ9UQP3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms