Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms