Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEFF2Q9UIK5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms