Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms