Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH3Q9UHC1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms