Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DUX4Q9UBX2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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