Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS29Q9UBQ0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS29Q9UBQ0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms