Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms