Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms