Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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