Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms