Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL11Q9NVR0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms