Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG3Q9NT62 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG3Q9NT62 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms