Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms