Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms