Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms