Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAF1Q9H7N4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCAF1Q9H7N4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms