Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLIRPQ9GZT3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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